百香果连作对土壤细菌群落结构的影响(二)
从图1(a)的百香Sobs 指数稀释曲线可知,随着测序数据量增加,果连Sobs 指数逐渐趋于平缓,作对说明测序数据量合理;Shannon多样性指数曲线随着样本测序数据的土壤增加,最终趋于平坦(图1b),细菌响说明测序数据能反映样本中绝大多数的群落微生物多样性信息。 不同连作年限百香果土壤细菌多样性指数如表2所示,结构其Coverage指数表示样本的百香文库覆盖率,其数值越高,果连表示样本中序列被测出的作对概率越高,如表2所示,土壤各样本Coverage指数均大于98%,细菌响说明各样本细菌基因序列被检出的群落概率较高,能较真实地反映样本的结构细菌群落;Ace和Chao指数反映细菌群落的丰富度程度,指数值越高,百香样本细菌丰富度越高;Shannon指数和Simpson指数反映样本中细菌群落的多样性程度,Shannon值越大,表明细菌多样性越高,Simpson指数值越大,表明细菌优势度越高,均匀性越低,多样性越低。各样本Ace、Chao、Shannon和Simpson指数差异显著(P<0.05),如表2所示,随着种植年限的增加,百香果种植土壤细菌的丰富度、多样性指数均呈先增加后降低的趋势,其中Ace和Chao指数在种植第二年时达到最大,Shannon多样性指数在连作第三年时达到峰值,Simpson指数在前三年逐渐降低,连作4年时与撂荒地相近。上述结果说明连作能显著影响百香果根区土壤细菌群落的多样性。 声明:本文所用图片、文字来源《热带作物学报》,版权归原作者所有。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系删除。 相关链接:土壤,细菌,样本2.2 稀释曲线与Alpha多样性分析
2.2.1稀释曲线
2.2.2 Alpha多样性分析
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